Цитата из книги Колодец времени (Татьяна Семенова, Павел Кузьменко)
«Paganus - деревенщина (лат.). С началом новой эры христианство в Римской империи распространялось в основном среди городского населения. И постепенно среди христиан появился презрительный термин religio pagana - "деревенская, мужичья вера", которым обозначалось язычество. В 4 веке христиан было много уже и в деревне, и слово "паганус" обрело второй смысл - "язычник", а за ним и третий - "нечистый", "мерзкий". Именно от третьего значения в русский и другие славянские языки пришли слова "поганый", поганка" и пр. »